利用電腦模擬訓練系統，已經成為全世界重要且必然的訓練趨勢，而國家中山科學研究院多年來也努力建立模擬系統的國內自主研發能量。事實上，目前國軍不少主要武器裝備的模擬訓練系統，都是由中科院負責研製。
中科院自1993年與外國廠商合作，完成第一套F-CK-1型經國號戰機的雙球戰術型模擬器以來，至今已研發完成的模擬訓練系統，主要可分為陸、海、空用載具，以及射擊訓練、特殊用途等5類，並已有超過240套各式模擬訓練系統由國軍接收使用。
中科院在配合自製經國號戰機研發計畫，與外商合作發展模擬器之後，1997年研發完成自製的F-CK-1型戰機飛行模擬器。2000年，利用F-5E型戰機的真實座艙，完成F-5E飛行模擬器，此外還研發經國號戰機的逃生程序訓練器。
2002年，研發具備F-5E、F-16型戰機，以及通用型直升機操縱介面的空間迷向機。2004年，為陸軍研製TH-67型教練直升機的飛行模擬器，以及M60A3型戰車組合型訓練模擬器。
2005年，結合觀測望遠鏡及雷觀機，為陸軍研發砲兵前進觀測模擬器。2007至2012年，完成T91式5.56公厘步槍的射擊模擬器，並在本、外島的18處建置26套系統。2008年，完成空軍AT-3型自強號高級教練機的飛行模擬器。
2009年，研發F-16型戰機的飛行模擬器，以及戰場心理抗壓模擬系統。2010年跨足海用裝備，為海軍研發劍龍潛艦教練儀，可實施潛艦的浮航、潛航操作程序訓練。
2011至2016年，研發多武器射擊模擬器、可攜式單兵射擊模擬器，以及組合型戰鬥射擊系統、沉浸式互動射擊系統、VR（虛擬實境）球型槍塔射擊系統。2012年，完成空軍的飛航管制訓練系統。2013年，為海軍研製神鷹武器教練儀，可進行S-70C(M)型直升機的飛行、反潛作戰訓練。
2017年，完成海軍的海練1號教練儀。2018年，研發海練4號教練儀，可提供海軍實施單艦、雙艦協同或海空聯合的反潛訓練；此外也完成陸軍的實兵模擬接戰系統。2019年進軍民用市場，為台灣高鐵研發駕駛模擬器。
2020年，完成空軍T-34C型初級教練機的飛行模擬器。2021年，研發自製雲豹裝甲車的8輪甲車組合型訓練模擬器，以及自製T-BE-5A型勇鷹號高教機的飛行模擬器。2022年，為海軍陸戰隊研發AAV7型兩棲突擊車組合型訓練模擬器；此外還完成直升機作戰系統，可提供陸軍AH-64E、UH-60M型直升機的多機戰術操演。2023年，研製戰術戰傷模擬訓練系統。
中科院最新的研發成果，則是2024年的DMS雙聯裝刺針飛彈模擬器，可提供雷情、目獲、敵我識別等接戰程序訓練。未來中科院將應用AI、VR等技術，除了滿足國軍的戰訓需求之外，更希望將模擬技術應用到民生領域。
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