民進黨政府的兩岸政策遭疑出現不同論調，行政院長卓榮泰今（5）日受訪表示，中華民國是主權獨立的國家，中華民國台灣也是中華民國，跟中華人民共和國互不隸屬，要維持的就是這個現狀；並呼籲國人，口徑一致，沒有分裂，才能用更大的力量來防衛我們自己。
賴總統上任後多次提及，「中華民國與中華人民共和國互不隸屬」。陸委會副主委梁文傑日前則說，兩岸實質就是兩個國家，指不把對岸當一個國家「很荒謬」。
陸委會主委邱垂正昨指出，賴清德總統在520就職演說開頭就表示「依據中華民國憲政體制」，其中就包含《中華民國憲法》及其增修條文，以及《兩岸人民關係條例》等相關法規。
上述說法遭外界質疑，論調不一。卓榮泰今於立院受訪表示，「中華民國就歷史來看，就是一個主權獨立的國家，中華民國台灣也是中華民國，跟中華人民共和國互不隸屬，這就是歷史現狀，我們要維持的就是這個現狀。」
由於澎湖漁船遭大陸海警船登檢扣押，馬英九基金會執行長蕭旭岑呼籲，請賴政府以台灣人為念，回歸中華民國憲法的「一中原則」，在承認九二共識的基礎上，務實處理兩岸關係。
卓榮泰則說，把一些行政上的作業，或是疑似違規的情境，牽扯到高層級的政治事件，「我覺得是過慮了，而且也不需要，應該要明辨是非」。
卓榮泰認為，「在這個時候，不是任何承認哪一個對方要求我們的條件，就能夠化解對方對我們的威脅」，因此他呼籲國人，心理的建設要一致，大家如果口徑一致，沒有分裂，才能用更大的力量來防衛我們自己。
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