凱米颱風造成台南市畜牧損失嚴重，根據台南農業局統計數據，目前家禽包含雞、鴨、鵝死亡已達99萬隻，豬約死亡1,300隻。
凱米颱風夾帶暴雨，造成台南市不少地方淹水，有農民回報養雞場全場12萬隻雞都滅頂，而另一養雞場也死了7萬隻肉雞、700頭仔豬，災情慘烈。目前根據台南農業局統計數據，家禽包含雞、鴨、鵝死亡已達99萬隻，豬約死亡1,300隻。
此外，農作物也嚴重災損，台南市各農產業因受強風、豪雨侵襲，落果、枝條斷裂、泡水情形嚴重，影響作物生長，受損情形已達到天然災害救助標準，7月26日農業部也公告本市為農產業全品項農業天然災害現金救助地區，凡符合此項災害救助資格的農戶，請儘速於7月27日至8月5日止，向土地所在地公所提出申請。
農業局長李建裕表示，此次公告為農產業全品項現金救助，符合資格的農民請於7月27日至8月5日止，向土地所在地公所提出申請，申辦時請攜帶「身分證、印章、存款簿、土地所有權狀（或土地登記簿謄本）」，若是承租土地必須檢附有效期間內的「土地委託經營或租賃契約書」。如最近一年(含本年度)有通過產銷履歷驗證、申請農業相關保險或參加綠色環境給付計畫領有給付者，請一併提供相關證明文件。此外，農民可使用農業部開發「農產業天然災害現地照相」APP拍照上傳田區災損情形，各區公所可據以認定並免除現地勘查，加速救助審查流程。
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