民進黨在大罷免戰役失利後,賴清德總統有意對民進黨立院黨團進行全面改組,但黨團總召柯建銘卻不願交出兵符。據了解,雖然民進黨中央發起的黨團改組連署已獲超過三分之二黨團立委支持,但雙方對於交接時程仍存在歧見。

賴清德總統於9月3日晚間,依慣例在立法院開議前,在總統官邸宴請黨籍立委,柯建銘也出席餐敘。據與會人士透露,柯建銘在餐會中一反常態,發言次數明顯減少。在談及立院攻防時,也不再使用「要把國民黨掃進歷史焚化爐」等強硬措辭,而是表態願意與在野黨合作推動有利國計民生的法案,只要在不違法、不違憲的前提下,都願意和在野黨合作。唯一的但書是,對於法案「違憲與否」是各政黨的認知問題,民進黨團仍會堅守立場。
根據《聯合報》報導,有知情人士指出,柯建銘並非堅持要擔任「萬年總召」,但希望能夠延任至2026年初。目前雙方透過總統府秘書長潘孟安居中協調,預計在立法院9月中下旬開議前持續溝通。不過,此折衷方案仍遭到部分黨內立委反對,最終決策權掌握在賴清德總統手中。
