2013年7月國軍爆發「洪仲丘事件」，引發大批民眾上街道，同年8月立法院修法，將非戰時的軍事審判回歸普通司法體系，後續軍事檢察署、軍事法院也裁撤。時至今日，賴清德總統今（13）日主持國安高層會議，卻宣布要恢復軍事審判制度，讓軍法官回到第一線。
陸軍義務役士官洪仲丘原定於2013年7月6日退伍，卻於7月4日死亡，生前疑似遭到霸凌，國防部於同年7月15日公布行政調查報告指出，陸軍第6軍團指揮部及第542裝甲旅、第269機步旅均有違失，禁閉程序也有瑕疵。
洪仲丘事件爆發後，除了當時的陸軍司令李翔宙等多位軍官遭到懲處，時任國防部長的高華柱也請辭獲准。2013年8月6日，立法院三讀通過修正「軍事審判法」第1條、第34條和第237條，現役軍人在非戰時的軍事案件，回歸一般司法機關偵辦、追訴、處罰。
2013年8月7日，民進黨中常會曾邀請時任洪家義務律師的國防部長顧立雄，專題演講「軍中人權與軍事審判之後續變革」，據時任民進黨發言人的林俊憲轉述，民進黨認為軍事審判移轉到司法審判，不代表一般的司法審判素質會比較好，而是至少比較起來，一般正常司法審判的獨立性高，又可受到外部監督。
此外，賴清德也曾於2019年4月21日，針對時任高雄市長韓國瑜「台灣軍隊沒有軍法，就像『太監穿西裝』」的說法，批評韓國瑜「引喻失當」。他說，韓國瑜可能認為軍法很重要，但是對於許許多多國軍而言，其實對國家的忠誠度、使命感，以及國軍自身的榮譽感也非常重要，所以應該是要強調激勵國軍士氣這部分，保家衛國發揮戰鬥力應會更強。雖然國軍於平時不適用軍法，但戰時就適用軍法，應沒有韓國瑜所擔心的問題。
曾批評韓國瑜「太監穿西裝」說法的賴清德總統，如今卻親自宣布將恢復軍事審判。
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