海基會董事長鄭文燦在桃園市長任內,疑涉土地開發收賄遭查辦,500萬重金交保,國民黨立委認為,鄭文燦應立即請辭,有消息傳出,前監委吳豐山接任呼聲高。
根據《中時新聞網》的報導,知情人士指出,原本賴清德屬意的海基會董事長人選,就是前自立晚報社長、無黨籍的前監委吳豐山;但當時還在任上的蔡英文總統建議,「鄭文燦是執政團隊靈魂人物,你要善用他,給他當海基會董事長,對兩岸有幫助」;不過,當時蔡英文並不知道賴清德已「心有所屬」。
外界認為,鄭下吳上的機率很高。
從2019年的媒體專欄,可見吳豐山的兩岸論述,他並提到了與賴清德的相關對話。
吳豐山說,他再問「台獨論」,並且告訴賴清德,他從二十年前就白紙黑字主張:「兩岸分立、和平非戰、共存共榮、互利互惠。」而賴清德在答覆時,特別說明了「務實台獨工作者」,「務實」的意涵。
「我講的是台灣已經是一個主權獨立國家,今後只須務實的處理兩岸和平非戰的課題。事實上今天台灣有百萬人在中國經商或工作,政府有責任窮盡辦法加以保護;這就是我說『務實』的真正意涵。」賴清德說。
2021年,新冠疫情肆虐,國內疫苗嚴重短缺,大陸方面計畫捐贈的疫苗,被時任衛福部長陳時中以「我們不敢用」直接回絕。吳豐山當時則說,無論是日本、美國還是中國回報我們的疫苗,我們都應該樂意接受,老百姓敢不敢打是一回事,但刻意區隔這是「政治凌駕防疫」。